ماجستير في المعلوماتية الحيوية لعلم الجينوم الحسابي

تعد درجة الماجستير ("Laurea Magistrale") في "المعلوماتية الحيوية للجينوم الحسابي " مبادرة مشتركة بين جامعة ميلانو و Politecnico di Milano ، وسيتم تفعيلها بدءًا من العام الدراسي 2019-2020.

بشكل عام ، يهدف إلى تكوين "علماء بيانات الجينوم" ، أي الخريجين الذين سيكون لديهم معرفة كافية حول الأساس الجزيئي للأنظمة البيولوجية ؛ بنية ووظيفة الجزيئات البيولوجية وكيفية مشاركتها في العمليات الخلوية ؛ التقنيات والمنصات لتحليل الجينوم ؛ أدوات المعلوماتية الحيوية والتحليل الجيني ؛ والمنهجيات الإحصائية والحسابية لتحليل البيانات الجزيئية البيولوجية.

القبول مفتوح لجميع الطلاب الحاصلين على درجة البكالوريوس ("لوريا ترينالي") إما في البيولوجيا أو التكنولوجيا الحيوية أو ما شابهها أو علوم الكمبيوتر أو الهندسة أو الرياضيات أو الفيزياء.

من خلال حضور الدورات التي تدرس في BCG درجة سوف تتعلم عن:

1. تنظيم المعلومات في الجينوم والعمليات الجزيئية والخلوية على أساس التعبير الجيني وتنظيمه.
2. الطرق التجريبية المستخدمة في دراسة الجينات ووظائفها في الأنواع النموذجية المختلفة ، بدائية النواة وحقيقية النواة.
3. التقنيات المستخدمة في أبحاث الجينوم والجينوم الحديث ، مثل المقايسات القائمة على التسلسل من الجيل التالي (تسلسل الجينوم والإكسوم ، وتسلسل الحمض النووي الريبي ، وتسلسل ChIP-Seq ، وما إلى ذلك).
4. طرق وبروتوكولات تحليل المعلومات الحيوية في دراسات الجينوميات الوظيفية (تسلسل الجينوم والإكسوم ، تسلسل الحمض النووي الريبي ، تسلسل ChIP-Seq ، وما إلى ذلك).
5. المناهج الحسابية والرياضية والإحصائية الأساسية للمعلوماتية الحيوية وأدوات التحليل الجينومي.
6. تقنيات قواعد البيانات لتخزين وتنظيم البيانات.
7. تقنيات النمذجة والتحليل المستخدمة في بيولوجيا الأنظمة لدراسة التفاعلات في الأنظمة البيولوجية المعقدة.

يشتمل البرنامج ، كخطوة أساسية في تكوين الطلاب ، على تدريب في مختبرات البحوث إما في جامعة ميلانو أو Politecnico أو في معاهد البحوث الإيطالية أو الأجنبية الأخرى. سيتم وصف تجربة البحث في التدريب ونتائجها في أطروحة مكتوبة نهائية ، ستناقش أمام لجنة أطروحة.

المهمة والأهداف

تهدف درجة الماجستير المشتركة في "المعلوماتية الحيوية لعلم الجينوم الحسابي" (BCG) من Politecnico di Milano و Università Degli Studi di Milano إلى تزويد خريجيها بمعرفة كافية على الأساس الجزيئي للأنظمة البيولوجية ؛ بنية ووظيفة الجزيئات البيولوجية وكيفية مشاركتها في العمليات الخلوية ؛ تقنيات ومنصات تحليل الجينوم ؛ أدوات المعلوماتية الحيوية والتحليل الجينومي ؛ والمنهجيات الإحصائية والحسابية لتحليل البيانات الجزيئية الحيوية.

لذلك ، تتضمن درجة BCG أنشطة توفر معرفة متعمقة حول:

• تنظيم المعلومات في الجينوم والعمليات الجزيئية والخلوية على أساس التعبير الجيني وتنظيمه.
• الطرق التجريبية المستخدمة في دراسة الجينات ووظائفها في الأنواع النموذجية المختلفة ، بدائية النواة وحقيقية النواة.
• التقنيات المستخدمة في البحث الجينومي الحديث.
• طرق وبروتوكولات تحليل المعلومات الحيوية في دراسات الجينوميات الوظيفية.
• المناهج الحسابية والرياضية والإحصائية التي تقوم عليها المعلوماتية الحيوية وأدوات التحليل الجينومي.
• تقنيات قواعد البيانات لتخزين وتنظيم البيانات.
• تقنيات النمذجة والتحليل المستخدمة في بيولوجيا الأنظمة لدراسة التفاعلات في الأنظمة البيولوجية المعقدة.

المواضيع

ستقدم Università Degli Studi di Milano دورات تركز على الموضوعات البيولوجية ، بينما ستقدم Politecnico di Milano الدورات الحاسوبية.

السنة الأولى

الفصل الدراسي الأول

• المقررات الإجبارية: الكيمياء العضوية. المعلوماتية الحيوية والبيولوجيا الحاسوبية
• المقررات الاختيارية: علم الوراثة ، والبيولوجيا الخلوية والجزيئية. الكيمياء الحيوية؛ قواعد البرمجة والبيانات؛ الإحصاء

الفصل الدراسي الثاني

• المقررات الإجبارية: علم الجينوم والنسخ ؛ البرمجة العلمية تعلم الآلة؛ الإحصاء الحيوي

2nd سنوات

الفصل الدراسي الأول

• المقررات الإجبارية: علم الجينوم المتقدم وعلم التخلق ؛ الكيمياء الإنشائية بيولوجيا النظم وتحليل الشبكات
• المساقات الاختيارية: مشروع متعدد التخصصات ؛ الجينوم إدارة البيانات الكبيرة والحوسبة

فرص عمل

تهدف درجة ماجستير BCG إلى تدريب "علماء البيانات" ، المهنيين ذوي المهارات العالية القادرين على دمج المعرفة المتعمقة حول الأسس الجزيئية لعلوم الحياة مع المعرفة الحديثة للتقنيات والتقنيات الحالية للمعلوماتية الحيوية والتحليل الجيني. سيتم التركيز بشكل خاص على الجوانب الكمية والحسابية للجوانب اللاحقة ، والتي ستركز على التحليل والنمذجة وفهم النظم البيولوجية. الهدف النهائي هو التدريب في سياق متعدد التخصصات المتخصصين على استعداد لمواجهة التحديات الناشئة عن علوم الجزيئات الحيوية الحديثة في عصر ما بعد الجينوم ، وقادرين على اقتران ودمج المعرفة في علم الأحياء ، وعلم الوراثة ، وعلوم الكمبيوتر ، وهندسة المعلومات ، و الإحصاء في مختلف مجالات البحث الأساسي أو التطبيقي.

سوف الخريجين في BCG تكون بالتالي:

• شارك في تصميم وتنفيذ التحليلات الجينومية على نطاق واسع.
• تحديد واستخراج المعنى البيولوجي من النتائج التي تم الحصول عليها.
• أدوات وبروتوكولات تصميم لتحليل المعلومات الحيوية لأنواع مختلفة من البيانات التجريبية بشكل مستقل.
• تلعب دورًا محوريًا في مجموعات البحث التي تركز على البحث الجينومي الأساسي أو التطبيقي.
• التنسيق والإشراف على المشاريع والمجموعات البحثية التي تركز على المعلوماتية الحيوية والجينوميات.

قبول

الشرط الأساسي للوصول إلى برنامج درجة الماجستير في BCG هو الحصول على درجة البكالوريوس ("Laurea Triennale") التي توفر معرفة كافية إما (1) علم الوراثة ، والبيولوجيا الجزيئية ، والكيمياء الحيوية أو (2) علوم الكمبيوتر ، وهندسة المعلومات ، والرياضيات. أيضًا ، معرفة اللغة الإنجليزية مطلوبة ، كما هو محدد أدناه. يمكن للطلاب الذين لم يكملوا درجة البكالوريوس التقدم إذا كانوا يخططون للتخرج قبل 31 أكتوبر 2019 (انظر أدناه).

للعام الدراسي 2019-2020 ، سيتم قبول 50 طالبًا كحد أقصى في البرنامج ، ويتم اختيارهم على أساس معارفهم الأساسية ومقابلة شخصية.

متطلبات القبول

شروط القبول للطلاب الإيطاليين

يمكن للطلاب الإيطاليين التقدم إلى دورة شهادة BCG لدرجة الماجستير ، بشرط أن يستوفوا أحد المتطلبين التاليين:

• لقد أكملوا برنامج درجة البكالوريوس (Laurea Triennale) في أحد الفصول التالية:
  • التكنولوجيا الحيوية (فئة L2)
  • علم الأحياء (فئة L13)
  • علوم الزراعة والأغذية (فئة L26)
  • العلوم الدوائية (صنف L29)

وخلال دراساتهم ، حصلوا على ما لا يقل عن 30 CFU في المناطق البيولوجية (SSD BIO) مع ما لا يقل عن 18 CFU في علم الوراثة (BIO / 18) ، البيولوجيا الجزيئية (BIO / 11) والكيمياء الحيوية (BIO / 10)

أو

• لقد أكملوا برنامج درجة البكالوريوس (Laurea Triennale) في أحد الفصول التالية:
  • هندسة المعلومات (فئة L8)
  • علوم الكمبيوتر (فئة L31)
  • الفيزياء (فئة L30)
  • الرياضيات (فئة L35)

وخلال دراستهم ، حصلوا على ما لا يقل عن 30 CFU في مجالات علوم الكمبيوتر ، وهندسة المعلومات ، والهندسة الطبية الحيوية ، والرياضيات و / أو الإحصاءات (SSD INF / 01 ، ING-INF / 05 ، ING-INF / 06 ، MAT / 01 -09 ، و / أو SECS-S / 01) ، مع 6 CFU على الأقل في الرياضيات (MAT / 01-09) و 12 CFU على الأقل في واحد أو أكثر من المجالات التالية: علوم الكمبيوتر (INF / 01) ، معلومات الهندسة (ING-INF / 05) ، الهندسة الطبية الحيوية (ING-INF / 06) ، الإحصاء (SECS-S / 01).

يتم تطبيق نفس المعايير على المرشحين الحاصلين على شهادات جامعية أجنبية يعتبرها مجلس المعلمين مناسبة ، حيث يمكن تحديد التخصصات وعدد الاعتمادات المكتسبة لكل تخصص بشكل واضح. إذا لم يكن ذلك ممكنًا ، فسيتم فحص المستندات التي تثبت مهنة المرشحين بالتفصيل من قبل مجلس المعلمين من أجل تقييم ما إذا كانت خلفياتهم تتوافق مع المتطلبات السابقة.

يمكن للطلاب الجامعيين التقديم ولكن سيتعين عليهم الحصول على درجة البكالوريوس (Laurea Triennale) قبل أكتوبر 31st ، 2019.

شروط القبول للطلاب الأجانب

• الطلاب الحاصلون على درجة البكالوريوس في منطقة من تلك الموصوفة في النقطة السابقة (متطلبات الطلاب الإيطاليين) ، حيث يمكن تحديد الدورات التي يتم تدريسها في التخصصات المطلوبة بوضوح جنبًا إلى جنب مع عدد الساعات / الاعتمادات للدورات. إذا لم يكن ذلك ممكنًا ، فسيقوم مجلس المعلمين بفحص المستندات التي تثبت الحياة المهنية للطلاب من أجل تقييم ما إذا كانت خلفيتهم تتوافق مع المتطلبات السابقة.

متطلبات اللغة

• يجب أن يتقن الطلاب اللغة الإنجليزية بمستوى B2 من الكفاءة. الطلاب المسجلين بالفعل في جامعة ميلانو ، والذين ليس لديهم شهادة B2 أو ما يعادلها ، مدعوون لإجراء اختبار تحديد المستوى لإثبات مستوى كفاءتهم وتقديم دليل على ذلك أثناء المقابلة. في حالات استثنائية ، يمكن قبول الطلاب دون اختبار تحديد المستوى B2 بشرط أن يكون مستوى إجادتهم للغة الإنجليزية ، الذي تم تقييمه أثناء المقابلة ، جيدًا بشكل واضح.
• المعرفة الإيطالية ليست مطلوبة للحضور. ومع ذلك ، وفقًا لما تقتضيه اللوائح ، سيتعين على الطلاب الأجانب إثبات أنهم اكتسبوا المعرفة الأساسية باللغة الإيطالية قبل الأطروحة النهائية.

الاختيار والترتيب

سيتم قبول الطلاب الذين يستوفون الشروط المذكورة أعلاه في مقابلة مع أعضاء هيئة التدريس لتقييم معارفهم العلمية الأساسية.

يعد الإعداد الشخصي المناسب للمرشحين (في موضوعات الخلفية الخاصة بهم) ، وقدرتهم على التواصل باللغة الإنجليزية ، ودوافعهم عناصر حاسمة للقبول. ستقوم المقابلة بتقييم خبرة المرشح في الموضوعات المتعلقة بدرجة البكالوريوس.

ستقوم اللجنة بتقييم كل مقدم طلب على مقياس من 100 نقطة:

• سيتم منح ما يصل إلى 50/100 نقطة لاستئناف مقدم الطلب (نوع درجة البكالوريوس التي حضرتها ، ودرجات الامتحانات ، والدورات الإضافية التي حضرتها ، والدرجات الإضافية ، وما إلى ذلك)
• سيتم منح ما يصل إلى 50/100 نقطة للمقابلة.

الحد الأدنى للدرجات المطلوبة للقبول هو 60/100.

للعام الأكاديمي 2019-2020 ، ستجرى المقابلات للطلاب الإيطاليين والطلاب الأجانب المقيمين في إيطاليا في قسم العلوم البيولوجية ، Via Celoria 26 ، في 16 يوليو 2019 ، الساعة 9:30 صباحًا.

يمكن للمتقدمين الأجانب غير المقيمين في إيطاليا والذين حصلوا على درجة البكالوريوس في الخارج اختيار مقابلة عبر الإنترنت. في بداية المقابلة ، يجب على الطلاب إبراز بطاقة هوية سارية أو جواز سفر لتحديد الهوية.

التسجيل بعد القبول

بمجرد نشر النتائج ، يجب على الطلاب الذين يشغلون أول 50 منصبًا في ترتيب الجدارة إكمال تسجيلهم خلال الموعد النهائي المحدد في إشعار المسابقة. بعد ذلك ، إذا لم تكن أول 50 منصبًا متاحًا مشبعة بعد الموعد النهائي الأولي ، فسيكون التسجيل ممكنًا للطلاب ذوي تصنيف الجدارة الأقل ، بشرط أن يكونوا قد حققوا ما لا يقل عن 60/100 في اختبار القبول. لن يتم التحقق من صحة تسجيل الطلاب الجامعيين إلا إذا حصلوا على درجة البكالوريوس (Laurea Triennale للطلاب الإيطاليين) بحلول 31 أكتوبر 2019. يجب على الطلاب من الجامعات الأخرى ، عند التخرج بحلول 31 أكتوبر 2019 ، تقديم شهادة الدرجة الممنوحة في Segreteria Studenti.

المواضيع

ستقدم Università Degli Studi di Milano دورات تركز على الموضوعات البيولوجية ، بينما Politecnico di Milano الدورات الحاسوبية.

السنة الأولى

1st الفصل الدراسي

• الدورات الإلزامية: الكيمياء العضوية؛ المعلوماتية الحيوية وعلم الأحياء الحسابي
• المقررات الاختيارية: علم الوراثة ، وعلم الأحياء الخلوي والجزيئي. الكيمياء الحيوية؛ قواعد البرمجة والبيانات؛ إحصائيات

الفصل الثاني

• الدورات الإلزامية: علم الجينوم وعلم النسخ. البرمجة العلمية؛ التعلم الالي؛ الإحصاء الحيوي

2nd سنوات

1st الفصل الدراسي

• الدورات الإلزامية: علم الجينوم المتقدم وعلم التخلق. الكيمياء الإنشائية؛ بيولوجيا النظم وتحليل الشبكة
• المقررات الاختيارية: مشروع متعدد التخصصات؛ إدارة البيانات الجينومية الضخمة والحوسبة

تصنيفات QS 2023 (يونيو 2022)

• الأول في إيطاليا
• رقم 139 على مستوى العالم

من خلال حضور الدورات التي يتم تدريسها في درجة BCG ، ستتعرف على:

1. تنظيم المعلومات في الجينوم والعمليات الجزيئية والخلوية على أساس التعبير الجيني وتنظيمه.
2. الأساليب التجريبية المستخدمة في دراسة الجينات ووظائفها في الأنواع النموذجية المختلفة بدائية النواة وحقيقية النواة.
3. التقنيات المستخدمة في الأبحاث الجينية والجينية الحديثة ، مثل المقايسات القائمة على التسلسل من الجيل التالي (تسلسل الجينوم والإكسوم ، وتسلسل الحمض النووي الريبي ، وتسلسل ChIP-Seq ، وما إلى ذلك).
4. طرق وبروتوكولات تحليل المعلومات الحيوية في دراسات الجينوميات الوظيفية (تسلسل الجينوم والإكسوم ، وتسلسل الحمض النووي الريبي ، وتسلسل ChIP-Seq ، وما إلى ذلك).
5. المناهج الحسابية والرياضية والإحصائية التي تقوم عليها المعلوماتية الحيوية وأدوات التحليل الجينومي.
6. تقنيات قواعد البيانات لتخزين وتنظيم البيانات.
7. تقنيات النمذجة والتحليل المستخدمة في بيولوجيا الأنظمة لدراسة التفاعلات في الأنظمة البيولوجية المعقدة.

يتضمن البرنامج ، كخطوة أساسية في تكوين الطلاب ، تدريبًا داخليًا في مختبرات البحث إما في جامعة ميلانو أو بوليتيكنيكو أو في معاهد بحثية إيطالية أو أجنبية أخرى. سيتم وصف التجربة البحثية للتدريب ونتائجها في أطروحة مكتوبة نهائية ، على أن تتم مناقشتها أمام لجنة أطروحة.

تهدف درجة ماجستير BCG إلى تدريب "علماء البيانات" ، المهنيين ذوي المهارات العالية القادرين على دمج المعرفة المتعمقة حول الأسس الجزيئية لعلوم الحياة مع المعرفة الحديثة للتقنيات والتقنيات الحالية للمعلوماتية الحيوية والتحليل الجينومي. سيتم التركيز بشكل خاص على الجوانب الكمية والحسابية للجوانب اللاحقة ، والتي ستركز على التحليل والنمذجة وفهم النظم البيولوجية. الهدف النهائي هو التدريب في سياق متعدد التخصصات المتخصصين على استعداد للتعامل مع التحديات الناشئة عن علوم الجزيئات الحيوية الحديثة في عصر ما بعد الجينوم ، وقادرين على اقتران ودمج المعرفة في علم الأحياء ، وعلم الوراثة ، وعلوم الكمبيوتر ، وهندسة المعلومات ، و الإحصاء في مختلف مجالات البحث الأساسي أو التطبيقي.

وبالتالي سيكون خريجو BCG قادرين على:

• شارك في تصميم وتنفيذ التحليلات الجينومية على نطاق واسع.
• تحديد واستخراج المعنى البيولوجي من النتائج التي تم الحصول عليها.
• أدوات وبروتوكولات تصميم لتحليل المعلومات الحيوية لأنواع مختلفة من البيانات التجريبية بشكل مستقل.
• تلعب دورًا محوريًا في مجموعات البحث التي تركز على البحث الجينومي الأساسي أو التطبيقي.
• التنسيق والإشراف على المشاريع والمجموعات البحثية التي تركز على المعلوماتية الحيوية والجينوميات.